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Levantamentos #344

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Estudo Biópsias x Exame Laboratorial Anatomopatológico

Adicionado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses atrás. Alterado há 6 meses atrás.

Estado:
Novo
Prioridade:
Normal
Data de início:
31/10/2024
Data de fim:
01/11/2024 (Atrasado aproximadamente 7 meses)
% Completo:

50%

Tempo estimado:
(Total: 1:00 h)
Tempo gasto:
(Total: 1:00 h)

Descrição

A biópsia é um procedimento médico em que se coleta uma amostra de tecido de uma área específica do corpo para análise. Esse procedimento pode ser realizado em diversas partes do corpo, como pele, órgãos internos, tecidos moles e ossos, e é feito para investigar a presença de doenças, como infecções, inflamações, ou, mais frequentemente, câncer. Existem diferentes métodos de biópsia, incluindo biópsia por agulha, biópsia incisional (remoção de uma parte do tecido) e biópsia excisional (remoção total do tecido suspeito).

Após a coleta do tecido, é realizado o exame anatomopatológico . Este exame consiste em uma análise microscópica detalhada da amostra obtida na biópsia, conduzida por um patologista. O objetivo é identificar possíveis alterações celulares e teciduais que indiquem doenças ou alterações estruturais, como a presença de células cancerígenas, inflamações, ou degenerações. Esse exame utiliza técnicas de coloração e, em alguns casos, pode incluir métodos mais avançados, como imunohistoquímica, para proporcionar um diagnóstico preciso e orientar o tratamento mais adequado.

Na competência out/24 da tabela unificada de procedimentos, temos os seguintes procedimentos anatomopatológicos:

  • 02.03.02.002-2 - EXAME ANATOMO-PATOLOGICO DO COLO UTERINO - PECA CIRURGICA
  • 02.03.02.003-0 - EXAME ANATOMO-PATOLÓGICO PARA CONGELAMENTO / PARAFINA POR PEÇA CIRURGICA OU POR BIOPSIA (EXCETO COLO UTERINO E MAMA)
  • 02.03.02.006-5 - EXAME ANATOMOPATOLOGICO DE MAMA - BIOPSIA
  • 02.03.02.007-3 - EXAME ANATOMOPATOLOGICO DE MAMA - PECA CIRURGICA
  • 02.03.02.008-1 - EXAME ANATOMO-PATOLOGICO DO COLO UTERINO - BIOPSIA
  • 05.01.08.001-5 - BIOPSIA E EXAME ANATOMO-CITOPATOLOGICO EM PACIENTE TRANSPLANTADO

Pegando como exemplo o procedimento 02.03.02.003-0 - EXAME ANATOMO-PATOLÓGICO PARA CONGELAMENTO / PARAFINA POR PEÇA CIRURGICA OU POR BIOPSIA (EXCETO COLO UTERINO E MAMA), no atributo "Quantidade Máxima" temos o número 8 como o máximo de procedimentos que podem ser realizados.

Desta forma, solicita-se:

Coleta de dados na AIH e na APAC, em um período definido, para analizar se a quantidade de procedimentos de biópsia é compatível ou não com a quantidade de exames anatomopatológicos.

OBSERVAÇÃO IMPORTANTE : É necessário que a análise seja realizada considerando o CNS (Cartão Nacional de Saúde), a fim de delimitar o mesmo paciente realizando os dois procedimentos.

INFORMAÇÃO IMPORTANTE: @Daiane Ellwanger Araújo sugeriu realizar o primeiro estudo tomando como base a Biópsia de Próstata.

Encaminhamento: @Daiane Ellwanger Araújo informará posteriormente os códigos de procedimento.


Ficheiros

clipboard-202411011711-fbw31.png (52,3 KB) clipboard-202411011711-fbw31.png Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:11
clipboard-202411011712-cm0xo.png (39,7 KB) clipboard-202411011712-cm0xo.png Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:12
pacientes_inconsistentes.xlsx (9,49 KB) pacientes_inconsistentes.xlsx Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:17
resultado_final.xlsx (36,4 KB) resultado_final.xlsx Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:17
resultado_situacoes.xlsx (8,08 KB) resultado_situacoes.xlsx Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:17
meses_procedimentos.xlsx (23,5 KB) meses_procedimentos.xlsx Adeilson Moreira Campos Júnior, 01/11/2024 17:17

Sub-tarefa 2 (1 aberta1 fechada)

Banco de Dados #345: Construir script sql para gerar dataset para ser utilizado no estudo de Biópsias x AnatomopatológicoFechadoAdeilson Moreira Campos Júnior31/10/202401/11/2024

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Desenvolvimento #346: Construir script python para fazer a análise de correlação entre biópsias e exames anatomo patológicosEm cursoAdeilson Moreira Campos Júnior31/10/2024

Actions
Actions #1

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses · Edited

@Daiane Ellwanger Araújo informará os códigos de procedimento no card "Estudo biopsia X anatomo", URL: https://planner.cloud.microsoft/webui/mytasks/assignedtome/view/grid?tid=9a554ad3-b52b-4862-a36f-84d891e5c705

02.01.01.041-0 - BIÓPSIA DE PRÓSTATA

Actions #2

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

  • Relacionado a Banco de Dados #345: Construir script sql para gerar dataset para ser utilizado no estudo de Biópsias x Anatomopatológico adicionado
Actions #3

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

  • Subtask #345 adicionado
Actions #4

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

  • Subtask #346 adicionado

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses · Edited

O estudo foi feito da seguinte forma:

  1. Criação de dataset com os seguintes dados filtrados:
  • co_pa_proc_id = ('0201010410','0203020030')
  • co_pa_mvm BETWEEN '202301' AND '202312'
  • co_pa_ufmun = '355030'

Query:

SELECT
    *
FROM
    sia.tb_pa pa
WHERE
    pa.co_pa_proc_id in ('0201010410','0203020030')
    AND pa.co_pa_mvm BETWEEN '202301' AND '202312'
    AND pa.co_pa_ufmun = '355030';

Quantidade total de registros no conjunto de dados: 79226

Quantidade e percentual de cada agrupamento de CO_PA_DOCORIG:
Quantidade Percentual
I 78758 99.409285
C 468 0.590715

Quantidade e percentual de registros em relação ao CO_PA_AUTORIZ:
CO_PA_AUTORIZ igual a '000000000000000': 0 registros (0.00%)
CO_PA_AUTORIZ diferente de '000000000000000': 79226 registros (100.00%)

Quantidade e percentual de registros em relação ao CO_PA_CNSPAC:
CO_PA_CNSPAC nulo: 468 registros (0.59%)
CO_PA_CNSPAC não nulo: 78758 registros (99.41%)

Achados:

  1. A planilha pacientes_inconsistentes.xlsx apresenta registros onde CO_PA_MVM (competência) do exame anatomopatologico é anterior ao CO_PA_MVM da biópsia.

Não achei coerente, uma vez que faz-se a biópsia e em seguida faz-se o anatomopatológico, mas posso ter entendido errado a regra de negócio.

  1. O arquivo meses_procedimentos.xlsx apresenta CO_PA_CNSPAC, CO_PA_MVM da biopsia e CO_PA_MVM_anatomopatologico. A maioria dos registros apresenta a biópsia e o anatomopatológico na mesma competência.

  1. O arquivo resultado_final.xlsx apresenta, por CNS, a produção total por frequencia e valor (representada pelos campos SOMA_NU_PA_QTDAPR e SOMA_NU_PA_VALAPR), seguido da frequencia e valor do procedimento de biópsia (campos NU_PA_QTDAPR_biopsia e NU_PA_VALAPR_biopsia) e frequencia e valor do procedimento exame anatomopatológico (NU_PA_QTDAPR_anatomopatologico e NU_PA_VALAPR_anatomopatologico).

Esta planilha apresenta 630 registros regulares (1 biópsia e 1 exame) e 58 registros "irregulares" (1 biópsia e mais de 1 exame) para o mesmo CNS, conforme demonstrado na planilha resultado_situacoes.xlsx

      Quantidade	Percentual

Regular 630 0,795193497
Irregular 58 0,07320829

Desta forma, é necessário verificarmos os achados para validarmos o método ou não.

Actions #6

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

É necessário ampliar o estudo, analisando se, para os casos em que houve mais de um exame anatomopatológico, se esses exames foram feitos para algum outro tipo de biópsia.

Actions #7

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

Atualizar o estudo, realizando a mesma análise, mas retirando os procedimentos:

0201010569 - BIOPSIA/EXERESE DE NÓDULO DE MAMA
0201010666 - BIOPSIA DO COLO UTERINO
0203020065 - EXAME ANATOMOPATOLOGICO DE MAMA - BIOPSIA

Actions #8

Atualizado por Adeilson Moreira Campos Júnior7 meses

Resumo: refazer a consulta, considerando o seguinte universo de procedimentos:('0201010410','0203020030','0201010569','0201010666','0203020065')

SELECT
    *
FROM
    sia.tb_pa pa
WHERE
    pa.co_pa_proc_id in ('0201010410','0203020030','0201010569','0201010666','0203020065')
    AND pa.co_pa_mvm BETWEEN '202301' AND '202312'
    AND pa.co_pa_ufmun = '355030';
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